Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms