Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CYTH4Q9UIA0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH4Q9UIA0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms