Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP25Q9UHP3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms