Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHORDC1Q9UHD1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms