Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA9Q9UGM1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms