Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCF2Q9UG63 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms