Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms