Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms