Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms