Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMG20BQ9P0W2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms