Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms