Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED17Q9NVC6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms