Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms