Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER2Q9NSB8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER2Q9NSB8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms