Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms