Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHB16Q9NRJ7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms