Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms