Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms