Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAJC4Q9NNZ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms