Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAT1LQ9HCJ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms