Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms