Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms