Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LY9Q9HBG7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LY9Q9HBG7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms