Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPAP3Q9H6T3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP3Q9H6T3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms