Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C11orf49Q9H6J7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms