Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms