Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMBRA1Q9C0C7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms