Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms