Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM5Q9C035 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM5Q9C035 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms