Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms