Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTPBP4Q9BZE4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms