Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP4-3Q9BYR4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms