Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM14BQ9BX40 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM14BQ9BX40 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms