Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2Q9BX26 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYCP2Q9BX26 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms