Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REPIN1Q9BWE0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms