Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms