Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBB2BQ9BVA1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2BQ9BVA1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms