Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSG1Q9BU20 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms