Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms