Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRQ99707 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRQ99707 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRQ99707 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRQ99707 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms