Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POP1Q99575 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POP1Q99575 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POP1Q99575 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
POP1Q99575 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POP1Q99575 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POP1Q99575 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POP1Q99575 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms