Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms