Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRERF1Q96PN7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms