Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms