Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SENP8Q96LD8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms