Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms