Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LTV1Q96GA3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms