Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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SGF29Q96ES7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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SGF29Q96ES7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SGF29Q96ES7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SGF29Q96ES7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SGF29Q96ES7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SGF29Q96ES7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SGF29Q96ES7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGF29Q96ES7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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