Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CMTM5Q96DZ9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMTM5Q96DZ9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms