Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4CQ96DT6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms